Elles ont tué deux des hommes armés qui serait visiblement des combattants d'Al-Shabab, le groupe jihadiste.
Ils ont également secouru 82 personnes, y compris des civils et des fonctionnaires.
Pour l'instant, on ne sait toujours pas si d'autres victimes sont à déplorer.
L'attaque a commencé vers 19 h 00 (16h00 GMT) mardi.
Une fusillade a éclaté entre les combattants d'Al-Shabab et les membres des forces de sécurité qui gardaient les points de contrôle menant au palais présidentiel non loin de l'hôtel, rapporte l'AFP.
Des coups de feu et des explosions de grenades ont pu être entendus pendant la bataille.
"Nous pensions qu'ils étaient de la police, mais ils ont commencé à lancer des grenades et à nous tirer dessus à l'approche et nous avons donc échangé des coups de feu à la porte de l'hôtel", a déclaré un officier de police cité par l'agence de presse Reuters.
L'hôtel de la Ligue de la jeunesse somalienne (SYL), qui est populaire auprès des responsables gouvernementaux et des hommes d'affaires, a déjà été attaqué trois fois par Al-Shabab.
Le groupe lié à Al-Qaïda a déclaré dans un communiqué en ligne qu'il avait mené l'attaque.
Il mène régulièrement des attaques à Mogadiscio et ailleurs en Somalie, ciblant souvent des hôtels.
En août 2016, il a déclaré avoir été à l'origine d'un attentat à la bombe contre le même hôtel, qui a fait 22 morts.
(Yes)